光荣特库摩公布了《莱莎的炼金工房：常暗女王与秘密藏身处》的中字宣传片，介绍了游戏的即时策略战斗系统。
本作的战斗系统采用战况会随时变化的「即时策略战斗」，操作角色以外的人物也会同时行动。透过消费AP（行动值），玩家可以无视技能、必杀技与行动顺序，以「加速行动」优先使用技能或道具，AP值全队共享，因此也需要有策略地使用。当AP累积到最大值后「战术等级」就会提升，战斗自由度也会更高。